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电泳迁移率实验
人阅读 发布时间:2022-11-25 12:31
项目介绍 Project introduction
*凝胶迁移或电泳迁移率实验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是一种研究蛋白质和DNA序列相互结合的技术,可用于定性或定量分析。
原理简介 Principle introduction
*蛋白质可以与生物素标记的核酸探针结合,电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的速度慢,即表现为相对滞后。
目的蛋白与生物素标记的DNA探针结合,电泳时蛋白-DNA复合物比无蛋白结合的DNA探针在凝胶中泳动的速度慢,显影出现相对滞后条带。
EMSA类型 EMSA type
01 验证型EMSA
用于验证探针是否含有可与蛋白质结合的位点。将结合位点突变,以突变探针为对照,野生型探针出现迁移条带,而突变探针未出现迁移条带,则说明该探针含有可与蛋白质结合的位点。
02 竞争型EMSA
探针序列不变,不含修饰基团的探针称为冷探针。冷探针与标记探针竞争性地与蛋白结合,冷探针不显影出迁移条带。以冷探针为对照,标记探针出现迁移条带,而冷探针迁移条带减弱或消失,则排除了假阳性干扰,增加实验结果准确性。
03 超迁移EMSA
使用目标蛋白的特异性抗体,蛋白-探针复合物被抗体识别并结合,该三聚复合物在凝胶电泳中,迁移速率再次增大,出现在蛋白-探针复合物的上方的超迁移条带,验证了探针与目的蛋白的特异性结合。
注意要点 General condensed summary
▶亦可用于研究RNA结合蛋白和其相关RNA序列的相互作用。
▶ 如需要做超迁移,需提供IP级别的抗体。
▶ EMSA与酵母单杂交,可共同验证同一个问题。
项目流程 Project process
报价与周期 Quotation and work cycle
◎提取总蛋白
◎蛋白表达与纯化
文献分享 Research sharing
01
Nuclear factor kappa B/p65 plays a positive role in peroxisome proliferator-activatedreceptor δ expression in orange-spotted grouper , Epinephelus coioides.
期刊: Fish and Shellfish Immunology IF:3.298 发表时间:2020
Binding reactions of Ecp65 and EcPPARδ promoter. Biotin-labelled EMSA probes are incubated with lysates of HEK293T cells including Ecp65 protein. WT, wild-type probe; MT, mutated probe. Positive control indicates EcPPARδ +Protein, negative control indicates EcPPARδ-WT.
文章中EMSA实验由本公司提供相关服务。
02
Functional Analysis of IRF1 Reveals its Role in the Activation of the Type I IFN Pathway in Golden Pompano, Trachinotus ovatus (Linnaeus 1758).
期刊:Int J Mol Sci. IF:4.183 发表时间:2020
Binding reactions of IRF1 and ToIFNa3 prompter. Biotin-labeled EMSA probes were incubated with lysates of HEK293T cells containing ToIRF1 protein.WT,wild-type probe;MT:mutated probe.1,negative control;2,positive control;3,plus ToIFNa3-P2-WT5;4,ToIFNa3-P2-WT5 plus ToIRF1-Flag;5,plus ToIFNa3-P2-MT5;6,ToIFNa3-P2-MT5 plusToIRF1-Flag.
文章中EMSA实验由本公司提供相关服务。
*凝胶迁移或电泳迁移率实验(electrophoretic mobility shift assay,EMSA)是一种研究蛋白质和DNA序列相互结合的技术,可用于定性或定量分析。
原理简介 Principle introduction
*蛋白质可以与生物素标记的核酸探针结合,电泳时这种复合物比无蛋白结合的探针在凝胶中泳动的速度慢,即表现为相对滞后。
目的蛋白与生物素标记的DNA探针结合,电泳时蛋白-DNA复合物比无蛋白结合的DNA探针在凝胶中泳动的速度慢,显影出现相对滞后条带。
EMSA类型 EMSA type
01 验证型EMSA
用于验证探针是否含有可与蛋白质结合的位点。将结合位点突变,以突变探针为对照,野生型探针出现迁移条带,而突变探针未出现迁移条带,则说明该探针含有可与蛋白质结合的位点。
02 竞争型EMSA
探针序列不变,不含修饰基团的探针称为冷探针。冷探针与标记探针竞争性地与蛋白结合,冷探针不显影出迁移条带。以冷探针为对照,标记探针出现迁移条带,而冷探针迁移条带减弱或消失,则排除了假阳性干扰,增加实验结果准确性。
03 超迁移EMSA
使用目标蛋白的特异性抗体,蛋白-探针复合物被抗体识别并结合,该三聚复合物在凝胶电泳中,迁移速率再次增大,出现在蛋白-探针复合物的上方的超迁移条带,验证了探针与目的蛋白的特异性结合。
注意要点 General condensed summary
▶亦可用于研究RNA结合蛋白和其相关RNA序列的相互作用。
▶ 如需要做超迁移,需提供IP级别的抗体。
▶ EMSA与酵母单杂交,可共同验证同一个问题。
项目流程 Project process
报价与周期 Quotation and work cycle
◎提取总蛋白
◎蛋白表达与纯化
文献分享 Research sharing
01
Nuclear factor kappa B/p65 plays a positive role in peroxisome proliferator-activatedreceptor δ expression in orange-spotted grouper , Epinephelus coioides.
期刊: Fish and Shellfish Immunology IF:3.298 发表时间:2020
Binding reactions of Ecp65 and EcPPARδ promoter. Biotin-labelled EMSA probes are incubated with lysates of HEK293T cells including Ecp65 protein. WT, wild-type probe; MT, mutated probe. Positive control indicates EcPPARδ +Protein, negative control indicates EcPPARδ-WT.
文章中EMSA实验由本公司提供相关服务。
02
Functional Analysis of IRF1 Reveals its Role in the Activation of the Type I IFN Pathway in Golden Pompano, Trachinotus ovatus (Linnaeus 1758).
期刊:Int J Mol Sci. IF:4.183 发表时间:2020
Binding reactions of IRF1 and ToIFNa3 prompter. Biotin-labeled EMSA probes were incubated with lysates of HEK293T cells containing ToIRF1 protein.WT,wild-type probe;MT:mutated probe.1,negative control;2,positive control;3,plus ToIFNa3-P2-WT5;4,ToIFNa3-P2-WT5 plus ToIRF1-Flag;5,plus ToIFNa3-P2-MT5;6,ToIFNa3-P2-MT5 plusToIRF1-Flag.
文章中EMSA实验由本公司提供相关服务。